Sau Chiến tranh thế giới thứ hai, các nước cộng hòa thành viên của Liên bang Xô viết đã thay đổi cờ của họ để mang các sọc màu quốc gia. Tajikistan là đội cuối cùng trong số 15 hành động. Các lá cờ Tajik của Liên Xô trước đây có màu đỏ với biểu tượng hình búa, liềm và ngôi sao cộng sản thông thường phía trên tên của nhà nước bằng chữ vàng. Vào ngày 20 tháng 3 năm 1953, Tajikistan thêm hai sọc ngang, màu trắng trên màu xanh lục nhạt, vào Biểu ngữ Đỏ của Liên Xô với hình búa liềm vàng và ngôi sao đỏ viền vàng. Màu xanh lá cây tượng trưng cho nghề trồng nho và nông sản, trong khi màu trắng tượng trưng cho bông đã làm nên sự nổi tiếng của Tajikistan.
Tajikistan tuyên bố độc lập vào ngày 9 tháng 9 năm 1991, nhưng một lần nữa nước này lại chậm thay đổi quốc kỳ. Thiết kế mới, có từ ngày 24 tháng 11 năm 1992, kết hợp bốn màu sắc giống như lá cờ năm 1953. Màu xanh lá cây hiện nay được cho là đại diện cho sản xuất nông nghiệp, trong khi màu đỏ là “biểu tượng của chủ quyền nhà nước”. Màu trắng có nghĩa giống như trước đây, dùng để chỉ cây bông. Vương miện ở trung tâm sọc trắng được bao phủ bởi một vòng cung của bảy ngôi sao vàng: những ngôi sao này được cho là đại diện cho sự thống nhất giữa các tầng lớp xã hội khác nhau của đất nước, bao gồm công nhân, nông dân và trí thức.
